ยุคอาซูจิ–โมโมยามะ (ค.ศ. 1573–1600) ของ โชกุน

ดูข้อมูลเพิ่มเติมที่: ยุคอาซูจิ–โมโมยามะ

สมัยต่อมา ตำแหน่งเซอิไทโชกุนตกเป็นของโอดะ โนบูนางะ และผู้สืบทอด คือ โทโยโตมิ ฮิเดโยชิ ซึ่งเป็นยุคที่โชกุนมีอำนาจมากยิ่งกว่าก่อน ฮิเดโยชิยังถือกันว่า เป็นหนึ่งในผู้ปกครองที่ยิ่งใหญ่ของญี่ปุ่น